Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms