Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
COL22A1Q8NFW1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms