Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms