Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC155Q8N6L0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms