Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms