Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms