Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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RAB11FIP4Q86YS3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP4Q86YS3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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