Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L3Q7Z443 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L3Q7Z443 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms