Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms