Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms