Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms