Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC129Q6ZRS4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms