Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI0

OTOG, Otogelin, humanhuman

Predictions only

Length 2,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOGQ6ZRI0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTOGQ6ZRI0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms