Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms