Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms