Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms