Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms