Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIRMAQ69YN4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms