Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms