Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms