Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms