Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AGAP9Q5VTM2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms