Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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GFI1BQ5VTD9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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GFI1BQ5VTD9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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