Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms