Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms