Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC92Q53HC0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms