Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms