Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms