Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC96Q2M329 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms