Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDR2Q16832 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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