Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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SCN9AQ15858 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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