Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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