Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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