Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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