Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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