Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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