Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME4Q14997 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms