Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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