Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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