Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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