Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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