Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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