Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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