Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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ITGB3BPQ13352 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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