Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms