Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms