Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms