Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms