Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms