Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL16A1Q07092 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms